分子蒸馏的反应体系有均相与非均相，非均相反应中，经过一定加工的固体催化剂构成了蒸馏塔的填料，它既起催化作用又起精馏塔填料的作用。蒸馏已用于酯化，酯交换，醚化，皂化等反应和某些同系物，异构体的分离。任何温度下混合物的总蒸气压总是大于任一组分的蒸气压，由于它包括了混合物其它组分的蒸气压。由此可见，在相同外压下，不互溶物质的混合物的沸点，要比其中沸点zui低组分的沸腾温度还要低。蒸馏和分馏的差别主要在于，蒸馏只进行一次汽化和冷凝，分离出的物质一般较纯，要连续进行多次汽化和冷凝，分离出的物质依然是混合物，只不过沸点范围不同。
分子蒸馏利用混合液体或液-固体系中各组分沸点不同，使低沸点组分蒸发，再冷凝以分离整个组分的单元操纵过程，是蒸发和冷凝两种单元操纵的联合。与其它的分离手段，如萃取、吸收等相比，它的优点在于不需使用系统组分以外的其它溶剂，从而保证不会引进新的杂质。有效确保首先检查冷却水供给；只有冷却水供给充足的情况下加热锅才会启动加热直至设定温度。加热锅根据溶剂库提供的数据将温度加热至所需的温度。当所有的参数均在正确操纵的范围内时，将蒸发瓶放进加热锅，蒸发瓶开始旋转，真空泵开始抽气。假如蒸馏中止，马达移出加热锅，蒸发瓶停止旋转，系统自动打开通气阀门，加热锅自动封闭。
