分子蒸馏是一种特殊的液--液分离技术，它不同于传统蒸馏依靠沸点差分离原理，而是靠不同物质分子运动平均自由程的差别实现分离。当液体混合物沿加热板流动并被加热，轻、重分子会逸出液面而进入气相，由于轻、重分子的自由程不同，因此，不同物质的分子从液面逸出后移动距离不同，若能恰当地设置一块冷凝板，则轻分子达到冷凝板被冷凝排出，而重分子达不到冷凝板沿混合液排出。这样，达到物质分离的目的。
短程分子蒸馏仪是靠不同物质分子运动平均自由程的差别实现液液分离的仪器，能解决常规蒸馏技术不能解决的问题。短程分子蒸馏仪在操作有一些注意事项，在使用过程中需要注意，避免因操作失误使仪器发生故障。
1.各效分离器的液面需要严格控制，使其处于工艺要求的适宜位置。
2.在蒸馏容易析出结晶的物料时，管路、板式蒸发器、阀门等部位易发生结垢堵塞现象。因此需定期用水冲洗保持畅通，或者采用真空抽位等措施补救。
3.装置仪表需要经常调校，使其灵敏可靠。如果发现仪表失灵，要及时查找原因并处理。
4.设备、管路需要经常进行严格检查、探伤，特别是视镜玻璃要经常检查、适时更换，以防因腐蚀造成事故。
5.检修设备前，要泄压泄料，并用水冲洗降温，去除设备内残存的腐蚀性液体。
6.操作、检修人员应穿戴好防护衣物，避免热液、热蒸汽造成人身伤害。
