气相色谱仪是以气体为流动相，利用试样中各组分在气相和固定液液相间的分配系数不同，实现多组分混合物的分离，并进行定量分析的工具。在食品行业中应用的有农药残留如食品中有机磷氨基甲酸酯农药残留等分析、香精香料如香料单体含量分析、添加剂如山梨酸、苯甲酸等进行定量分析、脂肪酸甲酯分析、食品包装材料分析等。
　　气相色谱质谱联用仪在20世纪80年代出现，是将气相色谱仪与质谱仪进行联机使用的分析仪器，其中气相色谱仪作为进样器，质谱仪作为检测器，它将气相色谱的快速、高效分离与质谱的专一性、高灵敏性结构鉴定相结合，使气相色谱和质谱的各自优点得到充分利用，是对复杂混合物样品进行定性和定量的一种高效、高灵敏性的分析设备。随着该类仪器设备制造技术的日新月异，现在已成为化工、食品、环境科学等领域的重要分析工具，也是香味物质分析的仪器，更是、三聚氰胺等备受关注的有害物质食品安全目标化合物的高效检测工具。
　　液相色谱仪是以溶液为流动相，采用冲淋法的柱色谱技术对高沸点、难气化的混合物实现分离后进行分析鉴定的仪器。主要应用于制药、环境、食品等行业的分析检测，在食品检测中常用于防腐剂如山梨酸类，色素类，非法添加物等的检测。结合国家相应的检测标准建立起相应的食品安全目标化合物的检测方法，保证食品安全。