激光焊接公焦显微镜和高速焊接，为了以细胞级即以微米级的空间分辨来观察生物体，同常先做组织切片标本，再利用光学显微镜观察。如果利用激光共焦显微镜，不做切片标本也能以同样的高分辨率观察生物体的活体从点光源的发出的经过透镜聚光后照射到试样内的观察点上，此时在试样内形成照射光的斑点，利用物镜通过空间滤波器使这些斑点在检测器上成像。这时空间滤波器的针孔置于与光源的焊接针孔共轭的位置上。该针孔作为空间滤波器起重要的作用。观测激光焊接机的点上会聚光的一部分，由于其前后的物体而收到散射，在原来的像前后成像针孔能够消除成为噪声的这些象，因而提高了所有得到像的对比度。为了得到二维的像，对照射斑点或试样还要进行扫描。以上用透射型模型说明了器原理，实际中采用反射型结构。与上述的OCT相同，被观测的光子是在组织内部结构所引起的反射或向散射光。但是OCT的空间的空间分辨率取决于光源的相干长度，而激光打码机共焦显微镜的分辨率取决于光路系统的数值孔径与波长。作为基本方法，OCT是观察组织的深度方向的断面，而激光共焦点显微镜则得到某一特定深度下的横向图像。