兰化所毛细管柱利用色谱柱先将混合物分离，然后利用检测器依次检测已分离出来的组分。色谱柱的直径为数毫米，其中填充有固体吸附剂或液体溶剂，所填充的吸附剂或溶剂称为固定相。与固定相相对应的还有一个流动相。流动相是一种与样品和固定相都不发生反应的气体，一般为氮或氢气。待分析的样品在色谱柱顶端注入流动相，流动相带着样品进入色谱柱，故流动相又称为载气。
兰化所毛细管柱分类与检测器的连接
在毛细管连接到检测器之前，先接通载气，看一下柱子的出口是否有载气通过，（将柱子出口浸进净水中看是否有气泡出现）假如没有载气从柱子出来，说明柱前的系统中有的地方漏气或柱子堵塞，应找出原因加以解决。然后将柱子的未端尽可能的伸到检测器（FID）的喷嘴以下的1~2厘米处（但不能超过喷嘴，并使柱子的出口处于气流的高流速区域（即氢气引进口以上），假如柱子不能直接伸到检测器的喷嘴下1~2厘米处，但必须伸到尾吹气进口的上部使柱子的未端处于气流的高速区域。
兰化所毛细管柱与进样器的连接
对于分流进样，毛细管柱的进口端一定要伸过分流进样器的分流出口，亦就是使毛细管柱的进口处于载气的高流速区域。假如毛细管柱的进口在分流进样器的分流出口以下，处于载气的低流速区域，得到的色谱图还不如填充柱，所以必须将毛细管的进口伸过分流进样器的分流出口，这样才会得到尖锐的峰形。对于分流/不分流进样，毛细管的进口应接到进样器的底部，这样可以使汽化管中的样品*进进柱子，也不会出现气流清洗不到的“死区”。
