Ion S5系统主要性能
? 无需复杂的光路系统, Ion Torrent半导体测序技术利用天然核苷酸反应, 实现高精度的变异捕获、 极其均一的覆盖度以及高度的检测灵敏度来探测低频变异。
? 相比市场上其他基于光学检测技术的测序平台, IonS5系统帮助希望引入新一代测序技术的实验室降低初期投入成本。
? 支持多种不同价格和通量的半导体芯片(Ion 510 Ion 520 Ion 530?和Ion 540?芯片), 从而为用户开展各类DNA/RNA测序应用项目提供更大的灵活性。
? 提供快的新一代测序仪运行速度。
? 依托用户与技术社区-Ion社区(IonCommunity)-这一社区目前已拥有超过3万名会员,会员人数仍在每天增长中。
? 较小的桌面占用空间, 仅需不到0.5平方米 (仪器尺寸:54.2 x 80.6 x 50.9 cm) 。
? 提供广泛的文库制备方案与试剂盒选择, 操作简单、快速, 起始样品需求量极低, 适用于微生物测序、靶向基因测序、 外显子组测序, 以及RNA测序等广泛研究应用。
? 与Ion Chef?系统或Ion OneTouch? 2系统配合使用, 实现简易快速的模板制备。
? 通过整合的T630服务器与Torrent Suite?软件, 实现从碱基识别到变异解析的完整解决方案。
? 运用Ion Reporter?软件对配对样品DNA变异的检测和分析, 提供简易和整合的三级数据分析工具。
系统流程、 技术参数与应用
性能 | 描述 |
简捷的靶向测序流程 | "简单、 快速的自动化工作流程: 靶向测序应用中, 从DNA样品输入到获 得分析数据*的完整过程中手工操作不到45分钟" |
? 文库制备: – Ion Xpress Plus片段文库试剂盒: 15分钟(手工操作时间) – 使用AB Library Builder实验方案实现自动化文库制备(13份样品): 10分钟(手工操作时间) – Ion AmpliSeq靶向富集和建库技术: ? 手动建库方案: 60分钟(手工操作时间) ? Ion Chef系统自动化建库方案: 15分钟(手工操作时间) ? 模板制备: – Ion OneTouch 2系统: 模板扩增, 手工操作时间2.5小时 – Ion Chef系统: 模板扩增与芯片上样, 手工操作时间15分钟 ? 测序: – 手工操作时间少于15分钟 ? 数据分析: – 从5百万读值数据(200 bp测序反应)获得比对好的BAM文件, 操作时间不到5小时" | |
快速的新一代测序 | 从DNA样品到获得变异结果快仅需两个工作日(8小时计算) |
? 测序反应仅需2.5-4小时即可完成 ? 使用Ion Xpress Plus片段文库试剂盒时, 基因组DNA与扩增文库制备仅需2.5小时; 使用Ion AmpliSeq靶向富集技术时, 仅需3.5个小时 ? 在Ion Chef系统上, 自动对两块Ion S5芯片进行模板制备与芯片上样 ? 在Ion S5 Torrent服务器上进行数据分析, 数小时之内完成变异检测报告
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高度灵活的通量 | 四款芯片分别提供从2百万至8千万的序列通量, 用户可以根据需求灵活选择 |
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每周样品通量高 | 每周可完成更多数量样品的完整靶向测序工作流程 |
? 模块化工作流程设计, 支持用户每周(5个工作日)进行多次测序 每台Ion S5系统每周可完成多达10次测序(200碱基读值) ? 模块化工作流程, 研究人员能够在一台Ion S5系统上多可同时操作384份标记样品, 每周多可检测3840份独立DNA样品 * 工作日以8小时计算。 | |
简捷、 直观的系统 | 盒装试剂与友好的用户界面, 为用户提供一个简捷的测序流程 |
? 在Ion Chef系统、 Ion OneTouch 2系统和Ion S5系统上, 用户可使用直观的触摸界面进行编程和操控 ? 用户可通过固定或移动设备(如iOS和Android设备)远程监控Ion S5测序仪 ? 行业标准数据格式(FASTQ、 SFF、 BAM、 VCF), 兼容第三方生物信息学软件提供的下游分析和可视化工具。 ? 模块化工作流程, 可在文库制备到测序的每一个环节中实施质量控制, 帮助用户节约时间, 降低试剂成本。 ? 通过盒装试剂与完整样品跟踪功能(RFID扫描)优化流程, 提高效率 | |
长碱基读长 | ? 200-、 400-与600-碱基读长 ? 兼容长mate-pair读长赛默飞ABI Ion GeneStudioS5XL系列基因测序仪 |
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